Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKIV2LQ15477 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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