Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR6A1Q15406 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms