Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUM3Q15397 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUM3Q15397 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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