Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB35Q15286 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB35Q15286 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms