Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A1Q14973 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A1Q14973 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms