Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IKBKEQ14164 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms