Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GTF2H2Q13888 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms