Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms