Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTAN1Q13813 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTAN1Q13813 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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