Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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