Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PMS2P11Q13670 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms