Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NAE1Q13564 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NAE1Q13564 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms