Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EIF4EBP1Q13541 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EIF4EBP1Q13541 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EIF4EBP1Q13541 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EIF4EBP1Q13541 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EIF4EBP1Q13541 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms