Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXE3Q13461 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXE3Q13461 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXE3Q13461 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FOXE3Q13461 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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FOXE3Q13461 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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