Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB2A2Q13296 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB2A2Q13296 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms