Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3FQ13275 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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