Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GRIN2BQ13224 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GRIN2BQ13224 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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