Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFX1Q12986 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFX1Q12986 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms