Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF2Q12933 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TRAF2Q12933 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TRAF2Q12933 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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