Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPRJQ12913 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTPRJQ12913 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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