Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms