Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC3A1Q07837 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC3A1Q07837 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms