Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TFF3Q07654 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TFF3Q07654 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms