Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR3Q06889 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms