Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FMODQ06828 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FMODQ06828 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FMODQ06828 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FMODQ06828 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FMODQ06828 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FMODQ06828 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms