Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A11Q02978 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms