Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU5F1Q01860 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms