Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK6Q00534 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms