Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB1P82279 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRB1P82279 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRB1P82279 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB1P82279 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB1P82279 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB1P82279 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB1P82279 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRB1P82279 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRB1P82279 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms