Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRPXP78539 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRPXP78539 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPXP78539 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPXP78539 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms