Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ASIC1P78348 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASIC1P78348 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms