Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPM4P67936 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPM4P67936 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPM4P67936 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPM4P67936 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPM4P67936 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPM4P67936 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms