Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF6P62330 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF6P62330 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF6P62330 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF6P62330 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms