Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms