Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO4P61968 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO4P61968 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO4P61968 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms