Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SPCS3P61009 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPCS3P61009 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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