Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAP25P60880 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms