Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STX17P56962 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STX17P56962 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STX17P56962 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX17P56962 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
STX17P56962 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX17P56962 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX17P56962 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STX17P56962 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STX17P56962 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STX17P56962 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms