Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB3P54284 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms