Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2A1P52655 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2A1P52655 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms