Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DAP3P51398 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DAP3P51398 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DAP3P51398 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DAP3P51398 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DAP3P51398 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DAP3P51398 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms