Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5CP51148 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RAB5CP51148 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RAB5CP51148 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB5CP51148 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RAB5CP51148 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB5CP51148 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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