Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK1EP49674 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK1EP49674 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms