Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIM1P49642 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRIM1P49642 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms