Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC34P49427 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC34P49427 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms