Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NESP48681 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NESP48681 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NESP48681 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NESP48681 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NESP48681 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NESP48681 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NESP48681 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NESP48681 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
NESP48681 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NESP48681 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
NESP48681 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NESP48681 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NESP48681 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NESP48681 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NESP48681 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NESP48681 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms