Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL29P47914 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms