Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACADSBP45954 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms