Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCAMP43121 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms