Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMPOP42166 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMPOP42166 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMPOP42166 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMPOP42166 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMPOP42166 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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